物流・倉庫業が使える補助金【2026年版】倉庫の自動化・在庫システム・倉庫新設の採択事例と申請のポイント

2026-10-29

「倉庫の人手が足りない」「出荷作業をもっと効率化したい」「在庫の管理をシステムにしたい」

物流・倉庫業の経営者の方から、よくいただくご相談です。人手不足が続く中で、倉庫の自動化やシステム化は避けて通れない一方、数百万〜数千万円の投資は簡単には決められません。

この記事の結論

  • 倉庫の自動化(無人フォークリフト・パレタイズロボット・ピッキングシステムなど)には、省力化投資補助金が使えます。カタログに載っている製品なら随時申請できます。
  • 在庫管理・倉庫システムを入れて新しいサービスを始めるなら、ものづくり補助金が候補です。補助率は1/2(小規模事業者は2/3)です。
  • 倉庫の新設を伴う新しい事業なら、建物費も対象になる新事業進出補助金が候補です。
  • ただし、トラックなどの車両や、人が運転する普通のフォークリフトは対象外です。

この記事では、物流・倉庫業が使える補助金、対象になる設備・ならない設備、全国の採択例、採択されるための事業計画のポイントを、中小企業診断士が解説します。ほかの設備も含めた全体像は「設備投資に使える補助金」で解説しています。

※本記事は2026年10月時点の情報です。補助額・補助率・スケジュールは公募回ごとに変わるため、申請時は最新の公募要領をご確認ください。


中小企業診断士 大場 隆史中小企業診断士大場 隆史

無料相談全国オンライン対応

物流・倉庫業の補助金申請は、お任せください

導入したい設備が補助金の対象になるか、どの補助金がいちばん有利かを、中小企業診断士の大場が無料でお答えします。

お問い合わせフォーム・LINEは24時間受付・1営業日以内にご返信します

物流・倉庫業は補助金の対象になりますか?

なります。中小企業・個人事業主の物流・倉庫業者は、ものづくり補助金・省力化投資補助金・新事業進出補助金の対象です。ポイントは、補助の対象は「倉庫の中の設備やシステム」で、トラックなどの車両は対象外という点です。

物流・倉庫業が使える補助金はどれですか?【2026年度】

倉庫で何をしたいかによって、使う補助金が変わります。

補助金 物流・倉庫での使い方 補助上限 補助率
省力化投資補助金
(カタログ注文型)
カタログに登録された無人フォークリフト・パレタイズロボット・ピッキングシステムなどを購入する 500万〜1,000万円
(従業員数による)
1/2
省力化投資補助金
(一般型)
自社の倉庫に合わせて、自動化の設備やシステムを組む 750万〜8,000万円
(従業員数による)
1/2
(小規模事業者は2/3)
新事業進出・ものづくり補助金
(革新的新製品・サービス枠)
在庫管理・倉庫システムを入れて、新しい物流サービスを始める 750万〜2,500万円
(従業員数による)
1/2
(小規模事業者は2/3)
新事業進出・ものづくり補助金
(新事業進出枠)
倉庫の新設を伴う、今とは違う新しい事業を始める(建物費も対象) 2,500万〜7,000万円
(従業員数による)
1/2

省力化投資補助金(一般型)の次の公募は、2026年11月上旬に始まり12月下旬に締め切られる予定です(第9回の解説)。ものづくり補助金の次の公募は2027年1月頃の予定です(新事業進出・ものづくり補助金の解説)。

このほか、国土交通省の「物流効率化推進事業」など、物流向けの国の制度もあります。対象や要件は制度ごとに異なるため、個別にご確認ください。

補助金の対象になるか、5つのチェック

次の5つがすべて当てはまれば、ものづくり補助金または省力化投資補助金の対象になる可能性があります。

  • ✓中小企業・個人事業主である(大企業ではない)
  • ✓導入する設備を、まだ発注・契約していない(見積もりを取っただけならOK)
  • ✓設備の導入で、新しいサービス・製品を始める、または作業を減らす(全く同じ設備の入れ替えではなく、性能が上がる・新しい機能が増える)
  • ✓設備の投資額が200万円以上(小規模事業者は150万円以上・税抜き)
  • ✓従業員が1名以上いる(パート・アルバイトを除く)

当てはまらない項目があっても、持続化補助金など、ほかの補助金が使える場合があります。自社が当てはまるか分からない場合は、中小企業診断士が無料でお答えします。

どんな設備が補助金の対象になりますか?

省力化投資補助金のカタログに載っている物流・倉庫の設備

省力化投資補助金(カタログ注文型)の製品カタログには、物流・倉庫で使える設備が多く登録されています(2026年10月時点)。

  • 無人フォークリフト(AGF)
  • ラックシステム(移動ラック・流動ラック・垂直回転ラック)、垂直搬送機(貨物専用)
  • パレタイズロボット
  • ピッキングシステム(ピッキングカートシステム、バラ積みピッキングロボット、デジタルピッキングシステム)
  • 包装・梱包の機械(ストレッチフィルム包装機、段ボール箱製函機など)

カタログに載っている製品は、登録された販売事業者から購入する形で、随時申請できます。製品は追加・変更されるため、最新の情報は公式サイトの製品カタログでご確認ください。

オーダーメイドの自動化・システム

カタログにない設備でも、省力化投資補助金(一般型)なら、自社の倉庫に合わせたAGV(無人搬送車)や搬送ライン、倉庫管理システムとの連携などを組み合わせて申請できます。また、在庫管理システムや倉庫管理システムを入れて新しいサービスを始める場合は、ものづくり補助金のシステム構築費として申請できます。

対象にならないもの

  • トラック・バンなどの車両
  • 人が運転する普通のフォークリフト(無人フォークリフト(AGF)は、カタログ型の対象です)
  • パソコン・タブレットなど、汎用性が高く他の用途にも使えるもの
  • 倉庫の建物(新事業進出補助金で新事業のために建てる場合を除く)

全国の物流・倉庫業では、どんな計画が採択されていますか?

ものづくり補助金の採択者一覧から、全国の物流・倉庫・運送に関わる採択例を12件ご紹介します(第20次〜第23次締切)。

所在地 事業計画名 公募回
北海道 倉庫・運送ノウハウを活かした十勝発・高付加価値肉の製品化 第20次
滋賀県 運送業の業務改革を推進する革新的な配送管理システムの構築 第22次
東京都 配車・動態・請求を一元化する物流業務統合システム開発事業 第23次
愛知県 3Dビジョンによるバラ積みピッキング自動化と新サービス展開 第23次
東京都 歯科物流を支える受発注・配送基盤構築事業 第22次
北海道 木質チップ製造事業への参入×既存の運送事業=高付加価値の創出 第21次
残り6件を見る
所在地 事業計画名 公募回
大阪府 物流マッチングによる空車削減DX事業 第23次
東京都 個別ニーズに対応できる搬送ロボット用倉庫制御システムの開発 第21次
長野県 建設現場における物流用ドローン導入による省力化・効率化事業 第22次
栃木県 AI・自動化設備による省人型いちご出荷モデル構築 第23次
東京都 配送料高騰に悩むEC事業者を救うAI型配送最適化SaaS事業 第21次
富山県 保管整備付きワンストップ機器再生事業 第20次

出典:ものづくり補助金総合サイト「採択者一覧」(第20次〜第23次締切)。事業計画名は原文のまま、事業者名は省略しています。

採択されている計画には、次のような共通点があります。

  • 配送・配車のシステム化が最も多い:配車・動態管理や配送管理のシステムで、運送業の業務を変える計画が目立ちます。
  • 倉庫作業の自動化:バラ積みピッキングの自動化や、搬送ロボット用の倉庫制御システムなど、人手のかかる作業を機械に置き換える計画です。
  • 倉庫・運送会社の新事業:倉庫・運送のノウハウを活かして、食品の製品化や木質チップの製造など、新しい分野に進出する計画も採択されています。

「設備やシステムを入れて何が新しくできるようになるか」をはっきり書くことが、物流・倉庫業でも採択の共通点です。

無料相談全国オンライン対応

物流・倉庫業の補助金申請は、お任せください

導入したい設備が補助金の対象になるか、どの補助金がいちばん有利かを、中小企業診断士の大場が無料でお答えします。

お問い合わせフォーム・LINEは24時間受付・1営業日以内にご返信します

物流・倉庫業が採択されるための事業計画のポイントは?

① 「何がどれだけ減るか」を数字で示す

ピッキングにかかる時間、1日に出せる出荷件数、誤出荷の件数など、今の数字と導入後の数字を並べて示します。省力化投資補助金では、どれだけ人手のかかる作業を減らせるかが審査の中心です。

② 新しいサービスにつなげる

ものづくり補助金で申請する場合は、「作業が楽になる」だけでなく、新しく何ができるようになるかを書きます。例えば、在庫システムで受託できる荷主を増やす、医薬品や冷凍品など新しい荷物を扱う、といった形です。

③ 対象外の経費を混ぜない

車両や汎用のパソコンなど対象外の経費が見積もりに混ざっていると、計画全体の印象が悪くなります。見積もりの段階で、補助の対象になるものとならないものを分けておきましょう。

申請前に確認すべきことは?

  • まだ発注・契約していないか:交付決定の前に発注した設備は対象外です
  • GビズIDプライムを取得しているか:電子申請に必要で、取得に数週間かかる場合があります
  • 資金の手当てができているか:補助金は導入後の後払いです(資金繰りの注意点)

よくある質問

Q. フォークリフトは補助金の対象になりますか?

人が運転する普通のフォークリフトは、車両の扱いになり対象外です。一方、無人フォークリフト(AGF)は、省力化投資補助金のカタログに登録されています。

Q. トラックの購入に使えますか?

使えません。ものづくり補助金・省力化投資補助金・新事業進出補助金では、トラックなどの車両は対象外です。

Q. 倉庫を建てる費用は対象になりますか?

ものづくり補助金・省力化投資補助金では対象外です。新事業進出補助金の場合は、新しい事業のために必要な建物費が対象になります。

Q. 運送業でも使えますか?

倉庫や荷役の設備・システムであれば対象になります。車両は対象外です。

RIGIDの補助金申請サポート

ものづくり補助金の採択率:90%(50/55件)

弊社は、製造業・物流から、歯科医院・動物病院などの医療分野まで、設備投資の補助金申請を数多くご支援してきました。事業計画づくりから採択後の実績報告まで、中小企業診断士が一貫してサポートします。

物流・倉庫の分野では、次のような採択をご支援しています。どちらも、投資額の3分の2を補助金でまかなった例です。

導入した設備・システム 補助金 投資額 補助金額
在庫システムの導入 ものづくり補助金 600万円 400万円
医薬品ECのための倉庫システムの導入 事業再構築補助金
(現在の新事業進出・ものづくり補助金 新事業進出枠)
1,200万円 800万円

物流・倉庫業の補助金相談はRIGIDへ

「この設備で補助金は使えるか?」「どの補助金で、いくら補助が出るか?」といったご相談から、事業計画の策定支援、採択後の手続きまで一貫してサポートします。初回のご相談は無料です。全国オンラインで対応していますので、機器が決まっていない検討段階からお気軽にお問い合わせください。

関連記事

全国オンラインで対応しています。下のお問い合わせフォームのほか、LINE・お電話でもご相談いただけます(無料)。

相談員

【この記事を読んだ方限定】

「使える?いくら戻る?」を無料で診断します

⚠ 補助金は予算がなくなり次第終了。使える今のうちにご相談を

    LINEで無料相談電話で相談する